Elektroforeza u poliakrilamidnom gelu (PAGE) ima širok spektar primjene u biološkim i biohemijskim istraživanjima, uglavnom u sljedećim aspektima:
Razdvajanje i identifikacija proteina : PAGE odvaja uzorke proteina djelovanjem električnog polja, odvaja ih prema veličini i razlici naboja proteina, a zatim ih analizira. Ova metoda se može koristiti za odvajanje i identifikaciju različitih proteinskih komponenti u uzorcima proteina i analizu molekularne težine i stanja naboja proteina.
Analiza molekularne težine proteina i stanja naboja : PAGE može analizirati molekularnu težinu i stanje naboja proteina prema njihovoj brzini migracije u električnom polju. Veliki molekularni proteini migriraju sporo, mali molekularni proteini migriraju brzo, pozitivno nabijeni proteini migriraju na katodu, a negativno nabijeni proteini migriraju na anodu.
Detekcija čistoće i sadržaja proteina : PAGE u kombinaciji s bojenjem ili drugim metodama detekcije može vizualizirati proteinske trake i izvršiti kvantitativnu analizu. Ova metoda se može koristiti za otkrivanje čistoće i sadržaja proteina.
Dalja identifikacija i kvantifikacija u kombinaciji sa drugim analitičkim metodama : PAGE se može kombinovati sa drugim analitičkim metodama kao što je masena spektrometrija radi dalje identifikacije i kvantifikacije odvojenih proteina. Ovo čini PAGE vrijednim u istraživanju proteomike.
Primjene SDS-PAGE i Native-PAGE: U zavisnosti od svrhe analize, PAGE se može pokrenuti pod uslovima denaturiranja ili bez-denaturiranja. SDS-PAGE eliminiše strukturne efekte i efekte naelektrisanja proteina kroz tretman denaturacije, dozvoljavajući im da budu odvojeni samo na osnovu molekularne težine; dok Native-PAGE zadržava strukturu višeg-poretka proteina i uglavnom se koristi za analizu prirodnog stanja i interakcija proteina