Prednosti elektroforeze u poliakrilamidnom gelu (PAGE) uglavnom uključuju sljedeće aspekte:
Mali elektroosmotski efekat: Poliakrilamidni gel je sintetička supstanca sa malim elektroosmotskim efektom i nije laka za interakciju sa uzorkom, što pomaže u smanjenju deformacije i difuzije uzorka tokom elektroforeze.
Podesiva veličina pora : Koncentracija monomera se može podesiti prije polimerizacije kako bi se formirali različiti stupnjevi unakrsno{0}}povezanih struktura, čime se mijenja poroznost gela. Ova fleksibilnost omogućava poliakrilamidnom gelu da odabere odgovarajuće komponente gela u skladu sa molekularnom veličinom supstance koja se odvaja, što ne samo da obezbeđuje efekat razdvajanja već ima i dobra mehanička svojstva.
Termička stabilnost: Unutar određenog raspona koncentracija, poliakrilamidni gel je termički stabilan, a gel je bezbojan i proziran, lako ga je uočiti i otkriti.
Dobar efekat odvajanja : Poliakrilamidni gel ima malu veličinu pora i posebno je pogodan za odvajanje velikih polinukleotidnih DNK ili RNK fragmenata i manjih proteina. Ova karakteristika mu omogućava da dobro radi u odvajanju složenih uzoraka i poboljšava rezoluciju elektroforeze.
Manje zagađenja: Akrilamid je relativno čisto jedinjenje i može se rafinirati kako bi se smanjilo zagađenje, što pomaže u održavanju točnosti eksperimentalnih rezultata.